Evolution der Pathogenität bei E. coli. Wie Bioinformatik hilft, Pathogenitätsfaktoren zu identifizieren.

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Autor/in	Wünschiers, Röbbe
Titel	Evolution der Pathogenität bei E. coli. Wie Bioinformatik hilft, Pathogenitätsfaktoren zu identifizieren.
Quelle	In: Praxis der Naturwissenschaften - Biologie in der Schule, 57 (2008) 4, S. 29-33Verfügbarkeit
Beigaben	Literaturangaben
Zusatzinformation	Zusatzmaterial des Verlags (1) Zusatzmaterial des Verlags (2) Zusatzmaterial des Verlags (3)
Sprache	deutsch
Dokumenttyp	gedruckt; Zeitschriftenaufsatz
ISSN	1617-5697
Schlagwörter	Vergleich; Sekundarstufe II; Computer; Unterrichtsmaterial; Bakterium; Biologie; Biologieunterricht; Biowissenschaften; Darmflora; Escherichia coli; Gen; Genom; Genomanalyse; Gentransfer; Krankheit; Protein; Nukleinsäure; Toxin; Infektion; Pathogenese; Datenanalyse; Datenbank; Programmiersprache; Naturwissenschaften; Bioinformatik; Analyse; Sequenz; Online-Angebot
Abstract	Von dem Enterobakterium E. coli existieren zahlreiche Stämme, von denen einige für den Menschen pathogen sind. So verursacht der Stamm O157:H7 massive Störungen im Magen-Darm-Trakt, die tödlich enden können, wohingegen der Laborstamm K12 nicht pathogen ist. Durch phylogenetische Genomanalysen konnte gezeigt werden, dass sich beide Stämme aus einem gemeinsamen Vorfahren entwickelt haben. Der Stamm O157:H7 hat wahrscheinlich durch horizontalen Gentransfer Pathogenitätsfaktoren aufgenommen. In diesem Beitrag sollen die Genome der beiden E. coli-Stämme mit einem bioinformatischen Ansatz verglichen werden. Dabei werden Methoden der vergleichenden Genomanalyse vorgestellt, mit deren Hilfe sich im Unterricht die Unterschiede der Stämme sowie potenzielle Pathogenitätsfaktoren ermitteln lassen. Hierfür stehen kostenfreie, öffentlich zugängliche Daten und Programme zur Verfügung. Als Software kommen die Programmiersprache AWK und die Sequenzanalyse-Suite BLAST zum Einsatz (Orig.).
Erfasst von	Landesinstitut für Schule, Soest
Update	2008/4

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